Penelitian ini adalah tentang distribusi vertikal fitoplankton di perairan pesisir barat dan timur Pulau Bunyu Kabupaten Bulungan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui jenis fitoplankton berdasarkan kedalaman air dan nilai kelimpahan, indeks keanekaragaman, indeks keseragaman dan indeks dominasi fitoplankton berdasarkan kedalaman air. Penelitian ini dilakukan selama dua bulan dari bulan Mei sampai Juni 2014. Sedangkan pengambilan sampel fitoplankton diambil pada kedalaman air 0,5, 3, 6 dan 9 meter. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa jumlah fitoplankton yang terdapat di perairan Bunyu terdiri dari 2 kelas dan 23 spesies. Nilai kelimpahan fitoplankton yang tetinggi pada minggu ke 4 pada stasiun 2 dengan kedalaman air 6,0 meter sebesar 95 sel/L. Selanjutnya, nilai kelimpahan fitoplankton yang terendah pada minggu ke 4 stasiun 1 dengan kedalaman air 9 meter sebesar 8 sel/L. Nilai indeks keanekaragaman setiap minggu pada stasiun 1 dan 2 menggambarkan kondisi fitoplankton memiliki kenekaragaman jenis dan kestabilan komunitas rendah, karena nilai keseragaman mendekati 1. Indeks Keseragaman di perairan Bunyu menunjukkan bahwa kelimpahan fitoplankton antara jenis merata dan indeks dominasi umumanya tidak menujukan adanya jenis yang mendominasi.
Kata Kunci: Distribusi Vertikal Fitoplankton, Nilai kelimpahan, keanekaragaman, keseragaman dan dominasi fitoplankton

This research is about vertical distribution of phytoplankton in western coastal waters and eastern Bunyu island of Bulungan regency, which have done at Bunyu’s waters of Bulungan regency. The objective of this research are to find out the type of phytoplankton based on water depth and abundance’s value, diversity index, uniformity index and domination index of phytoplankton based on depth value. This research was done on two months form May until June 2014. Whereas, the sampling of phytoplankton was taken on water depth 0,5, 3, 6 and 9 meter. The result of this research shows that the number of phytoplankton which located in Bunyu’s waters consists of 2 classes and 23 species. The highest value of phytoplankton’s abundance was founded on fourth weeks in station 2 with water depth 6,0 meter in amount of 95 sel/L. The value of diversity index each week on station 1 and 2 shows that conditions of phytoplankton has biodiversity and low community’s stability, because the value of diversity close to 1. Diversity index in Bunyu’s waters shows that phytoplankton’s abundance between species evenly and domination index generally showed there is no species that dominates. Keywords: Vertical distribution of Phytoplankton, Value of abundance, diversity, uniformity and domination of phytoplankton