Drainase Bandar Udara Juwata Tarakan merupakan salah satu drainase yang dibuat untuk mengurangi debit banjir yang sering meluap dari saluran. Pada drainase yang berada di daerah Bandar Udara Juwata Tarakan memiliki peranan penting dalam pengendalian banjir pada daerah tersebut. Di sisi lain, daerah muara pada drainase ini merupakan daerah yang mengalami proses sedimentasi tinggi akibat pertemuan dua cabang saluran drainase yang membawa sedimen. Penelitian terhadap aliran air pada drainase Bandar Udara Juwata ini diharapkan mampu mengetahui angkutan perpindahan sedimen serta kaitannya dengan aliran drainase, karena sedimentasi yang terjadi pada suatu aliran sungai atau drainase akan mengakibatkan menurunnya kecepatan aliran drainase tersebut. Berdasarkan hasil simulasi quasi-unsteady flow dari tanggal 1 September 2015 sampai dengan 2 September 2015 dengan menggunakan HEC-RAS 4.1.0 diketahui sedimentasi terjadi di hampir sepanjangan drainase Bandar Udara Juwata Tarakan. Pengendapan tertinggi terjadi pada STA +0.000 yaitu pada Hilir drainase Bandara 1 sebesar 1392,589 m3/ hari dan pada STA +0.250 pada pertengahan drainase Bandara 2 yaitu sebesar 457.444 m3/ hari.

Drainage of Juwata Tarakan Airport is one of the drainage to reduce discharge the flood which overflowed from the water way. The drainage in Juwata Tarakan airport has an important role for flood control in the area. On the other hand, the downstream of drainage have high sedimentation process because the meeting of two branches channel drainage bring sediment. Research on of water flow at drainage Juwata Tarakan airport is expected to know displacement sediment transport and relation to the flow of drainage, because sediment occurring at a stream or drainage will result in decline speed of drainage flow. Based on the results of simulation quasi-unsteady flow from 1st september 2015 up to 2 september 2015 by using hec-ras 4.1.0, sedimentation it happens in almost drainage channel of Juwata Tarakan airport.The highest sedimentation in STA + 0.000 downstream of drainage 1 is 1392,589 m3/ day and on STA + 0.250 in the middle of drainage 2 is 457.444 m3/ day.