Ikan layang merupakan komoditas perikanan dan termasuk ikan pelagis yang hidup secara bergerombolan diperairan. Salah satu dasar pengelolaan sumberdaya ikan layang adalah melalui informasi dasar mengenai jenis ikan yang akurat. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis ikan layang yang diperdagangkan di Pasar Beringin kota Tarakan secara morfologi dan molekuler serta mengetahui karakteristik molekuler lainnya. Tahapan penelitian dilakukan dengan menganalisis karakter molekuler dan morfometrik ikan layang. Pada tahapan molekuler dilakukan dengan metode DNA Barcoding melalui proses ekstraksi DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis DNA hasil PCR dan sekuensing DNA. Sekuen dicocokkan dengan data pada NCBI untuk mengetahui spesies ikan layang. Berdasarkan hasil analisis morfologi dan molekuler pada sampel ikan layang diketahui bahwa sampel tersebut merupakan spesies Decapterus macrosoma dan masih dalam satu clade dengan Decapterus macrosoma dari perairan lain dengan jarak genetik kurang dari dari 3%.
Kata kunci: Decapterus macrosoma, Ikan Layang, Karakter Morfologi, Karakter Molekuler, DNA Barcoding, Tarakan

Flying fish is a fishery commodity belonging to pelagic fish that live in groups in the waters. One of the management of flying fish resources is through the basic information about kinds of fish species accurately. This study aimed to identify the types of flying fish thet are traded moleculer characteristics. The stage of the research were carried out by analyzing the molecular and morphometric characteristics of the flying fish. The molecular phase was done by DNA Barcoding method through DNA extraction, amplification, electrophoresis, and DNA sequencing from the result of PCR. Sequences synchronized white the data at NCBI, the process to determine yhe species of flying fish. Based in the result of morphological and molecular analysis of the flying fish, it is known that the species from the sample is a kind of Decapterus macrosoma and is still in the same clade as Decapterus macrosoma from the other waters with a genetic distance of less than 3%. Keyword: Decapterus macrosoma, flying fish, morphological characteristic, molecular characteristic, DNA barcoding, Tarakan City