Ikan cupang merupakan salah satu ikan yang sangat digemari oleh masyarakat terkait dengan memiliki tubuh yang unik dan mudah untuk dipelihara. keunikannya menjadi bagian yang harus diekplor lebih jauh, karena jenis ini memiliki keragaman yang cukup tinggi di indonesia. salah satu upaya mempertahankan keragaman dengan menelaah tingkat kekerabatan. ikan cupang lokal desa sebidai secara morfologis diduga memiliki kekerabatan dengan ikan cupang tanjung batu kota tarakan. tujuan penelitian untuk mengetahui jenis ikan cupang lokal yang di temukan di perairan rawa sebidai kabupaten tana tidung, untuk mengetahui karakter morfologis ikan cupang lokal, dan untuk mengetahui jarak genetik dan tingkat kekerabatan ikan cupang lokal berdasarkan penanda molekuler gen coi. jenis yang akan dikaji tingkat kekerabantannya adalah ikan cupang di desa sebidai dan tanjung batu, kota tarakan. metode pendekatan dilakukan berdasarkan penanda molekuler gen coi. secara teknis hasil tersebut akan divalidasi dengan menggunakan genbank. penelitian dilaksanakan pada bulan september hingga desember 2020. sampel empat spesies diambil dari masing-masing lokasi, dan genbank dengan menggunakan software mega x. hasil analisis menunjukkan bahwa 4 contoh sampel ikan tidak memiliki hubungan dengan spesies yang bersal dari genbank (betta pi, betta pugnax, betta spelendens, betta imbelis) dengan nilai homologi 86,81%. hasil analisis jarak genetik dari 4 sampel. kata kunci: gen coi, genetik, hubungan kekerabatan, morfologi

Betta fish is one of the fish that is very popular with the community because is has a unique body and is easy to maintain. its uniqueness is a part that must be explored further, because this species has fairly high diversity in indonesia. one of the efforts to maintain diversity is by examining the level of khinship. the local betta fish in sebidai village are morphologically thought to have a relationship with the tanjung batu betta, tarakan city. the research objectives were to determine the types of local betta fish found in the waters of sebidai swamp, tana tidung regency, to determine the morphological characters of local betta fish, and to determine the genetic distance and level of kinship of local betta fish based on molecular markers of the coi gene. the spesies that was studied for its virginity level was betta fish in sebidai and tanjung batu villages, tarakan city. the method was based on molecular markers of the coi gene. technically, these results were validated using genbank. the research was conducted from september to desember 2020. samples of four spesies were taken from each location, and genbank using mega x software. the analysis showed that 4 fish sample had no relationship with species originating from genbank (betta pi, betta pugnax, betta spelendens, betta imbelis) with a homology value of 86.81%. results of genetic distance analysis were of 4 samples. keywords: coi gane, genetic, kinship, morphology