Spesies ikan pari memiliki kekerabatan dekat dengan spesies lainnya yang memiliki kesamaan dan karakter morfologi saling tumpang tindih dan sulit untuk membedakan spesiesnya. salah satu metode untuk mengidentifikasi spesies pari yaitu dna barcoding. dna barcoding adalah metode molekuler untuk mengidentifikasi spesies yang memanfaatkan rantai dna pendek berupa penanda mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1. penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi karakter morfologi beserta karakteristik genetik ikan pari yang diambil di perairan muara sesayap kabupaten tana tidung menggunakan metode dna barcoding. objek yang akan diteliti adalah ikan pari jantan genus maculabatis. pengambilan sampel ikan pari dilakukan pada bulan februari 2023 di perairan muara sesayap kabupaten tana tidung. tahapan ekstraksi dna hingga tahap pcr dilaksanakan di laboratorium dan tahapan sekuensing dilaksanakan oleh jasa sekuensing. sampel uji ikan pari memiliki 2 karakter morfologi yang berbeda dengan ukuran terpanjang yaitu 47 cm dengan lebar 59 cm dan terpendek 32 cm dengan lebar 41 cm. validasi basa nukleotida sampel menunjukkan panjang rantai basa nukleotida mencapai 687. jenis ikan pari dari perairan muara sesayap kabupaten tana tidung berdasarkan uji molekuler yaitu jenis maculabatis gerrardi dengan tingkat kemiripan 100% dengan sekuen dari malaysia dengan kode akses oq3885102.1 dari ncbi. kata kunci: dna barcoding, genetik, ikan pari, morfologi

Stingray species share close relationship with other species, having overlapping morphological characteristics that make species differentiation challenging. one method for identifying stingray species is dna barcoding. dna barcoding is a molecular technique used to identify species by utilizing short dna sequences from mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 markers. this study aims to identify the morphological and genetic characteristics of stingrays collected from the sesayap estuary waters of tana tidung regency using the dna barcoding method. the subject of this study is the male stingray of the genus maculabatis. sample collection of stingrays was conducted in february 2023 in the sesayap estuary waters of tana tidung regency. dna extraction and pcr processes were carried out in the laboratory, while sequencing stages were conducted by sequencing services. the stingray test samples exhibited two different morphological characteristics, with the largest measuring 47 cm in length and 59 cm in width, and the smallest measuring 32 cm in length and 41 cm in width. the validation of nucleotide bases in the samples showed a nucleotide chain lenght of 687 bases. the molecular test indicated that the stingray species from the sesayap estuary waters of tana tidung regency is maculabatis gerrardi, with a 100% similarity to the sequence from malaysia, with the accession code oq3885102.1 from ncbi. keywords: dna barcoding, genetics, stingray, morphology