UPT. Perpustakaan Universitas Borneo Tarakan | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION
Image of Identifikasi Spesies Ikan Lais Dari Sungai Rahayu (Selor) Di Kalimantan Utara Dengan Metode DNA Barcoding

Identifikasi Spesies Ikan Lais Dari Sungai Rahayu (Selor) Di Kalimantan Utara Dengan Metode DNA Barcoding

Pengarang : Harisna Pidar

Perpustakaan UBT : Universitas Borneo Tarakan,2024
    SKRIPSI

Abstrak Indonesia

Ikan lais merupakan salah satu ikan yang bersungut air tawar anggota famili siluridae. ikan lais berperan sebagai pemangsa dalam rantai makanan untuk menjaga kestabilan populasi organisme lain di dalam perairan. oleh karena itu, perlu dilakukan metode identifikasi ikan lais melalui dna barcoding. tujuan penelitian ini untuk mengidentifikasi spesies ikan lais yang berasal dari sungai rahayu (selor), kabupaten bulungan kalimantan utara berdasarkan karakter molekuler dengan menggunakan metode dna barcoding dan karakter morfologi. penelitian ini dilakukan dengan mengidentifikasi karakter molekuler melalui proses isolasi dan ekstraksi dna, amplifikasi dna menggunakan pcr, elektroforesis, dan sekuensing. setelah itu, dilakukan pengukuran karakter morfologi dan morfometrik. berdasarkan penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa spesies dalam penelitian ini diduga adalah spesies endemik karena dari sekian banyak ikan lais yang telah diteliti secara molekuler dan diunggah ke database bank gen, baik yang berasal dari perairan indonesia maupun perairan negara lain, karakter molekuler yang ditunjukkan dari persentase kemiripan berbeda jauh yaitu di bawah 90%. hasil analisis jarak genetik pada keempat sekuen dari sungai rahayu dapat dikatakan identik atau tidak ada perbedaan genetik dengan nilai jarak genetik 0, 000. rekontruksi filogenetik membentuk 3 clade utama berdasarkan pengelompokkan terhadap masing-masing satu spesies. kata kunci: coi, morfologi, dna barcode, jarak genetik, filogenetik

Abstrak Indonesia

Lais fish (cryptopterus sp) is one of the freshwater grumpy fish species of the siluridae family. lais fish act as predators in the food chain to maintain the stability of populations of other organisms in waters. therefore, it is required to carry out a method of identifying lais fish through dna barcoding the purpose of this study was to identify lais fish species originating from rahayu (selor) river, bulungan regency, north kalimantan based on molecular characters by using dna barcoding methods and morphological characters. this research was conducted by identifying molecular characters through the process of dna isolation and extraction, dna amplification using pcr, electrophoresis, and sequencing. then, morphological and morphometric character measurements were conducted. based on this study, it can be decided that the species of this study was assumed to be an endemic species because from many lais fish that had been studied molecularly and uploaded to the genbank database, both from indonesian waters and other countries' waters, the molecular characters shown from the percentage of similarity were extreme different, which was below 90%. the results of genetic distance analysis on the four sequences of rahayu river can be assumed to be identical or there was no genetic difference with a genetic distance value of 0.000. the phylogenetic reconstruction formed 3 main clades based on grouping of each species. keywords: coi, morphology, dna barcode, genetic distance, phylogenetic