UPT. Perpustakaan Universitas Borneo Tarakan | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION
No image available for this title

Identifikasi Spesies Ikan Pari Dari Sungai Sesayap Kabupaten Tana Tidung Kalimantan Utara Secara Molekuler Menggunakan Metode DNA Barcoding

Pengarang : Deva Ovianty Sinaga

Perpustakaan UBT : Universitas Borneo Tarakan,2023
    SKRIPSI

Abstrak Indonesia

Ikan pari sungai merupakan salah satu jenis ikan pari yang bisa hidup di perairan tawar, payau dan laut yang termasuk ke dalam famili dasyatidae. di indonesia ada empat spesies ikan pari sungai yang dilindungi penuh oleh kementerian kelautan dan perikanan karena mengalami penurunan populasi (iucn 2021) yaitu urogymnus polylepis, fluvitrygon oxyrhynchus, fluvitrygon signifier dan urolophus kaianus. oleh karena itu, perlu dilakukan identifikasi spesies ikan pari secara akurat dalam upaya membantu konservasi ikan pari dari sungai sesayap. tujuan penelitian ini untuk mengetahui kepastian nama spesies ikan pari yang ada di sungai sesayap, kabupaten tana tidung, kalimantan utara, berdasarkan karakter morfologi dan molekulernya (validasi spesies, jarak genetik, hubungan kekerabatan). morfologi diamati dengan membedakan bentuk tubuh, bentuk ekor, corak tubuh dan bentuk mata, selanjutnya diidentifikasi karakter molekuler melalui proses ekstraksi dna, uji konsentrasi dan kemurnian, amplifikasi dengan pcr, elektroforesis dan sekuensing. hasil identifikasi spesies berdasarkan karakter morfologi dan molekuler pada penelitian ini ditemukan semua spesies ikan pari dari sungai sesayap yaitu urogymnus polylepis dengan tingkat kemiripan 100% identik data yang tersimpan di genbank ncbi dan bold system yang statusnya sudah masuk dalam daftar merah yaitu terancam bahaya (iucn 2021). dari hasil analisis jarak genetik sekuen pari dari sungai sesayap dengan sekuen dari perairan lainnya yang dikumpulkan dari genbank ncbi nilai jarak genetik terdekat yaitu 0,000 dari perairan thailand. rekonstruksi filogenetik membentuk 3 clade yaitu clade 1 terdiri dari spesies urogymnus polylepis, clade 2 terdiri dari spesies urogymnus asperrimus dan himantura granulata sedangkan clade 3 terdiri dari spesies yaitu brevitrygon imbricata (out group). kata kunci: urogymnus polylepis, coi, iucn, jarak genetik, filogenetik

Abstrak Indonesia

The dasyatidae family of stingrays includes river stingrays, which can dwell in fresh, brackish, and seawater. urogymnus polylepis, fluvitrygon oxyrhynchus, fluvitrygon signifier, and urolophus kaiamus are the four species of river stingrays in indonesia that are entirely protected by the ministry of maritime affairs and fisheries owing to population reduction (iucn 2021). therefore, in order to aid in the conservation of stingrays from the sesayap river, it is essential to correctly identify stingray species. the purpose of this study was to identify the stingray species with certainty using morphological and molecular characteristics (species validation, genetic distance, and kinship links) in the sesayap river, tana tidung regency, north kalimantan. body shape, tail shape, body pattern, and eye shape were used to observe morphology. then, molecular characteristics were discovered using dna extraction procedures, concentration and purity testing, pcr amplification, electrophoresis, and sequencing. all stingray species from the sesayap river, specifically urogymnus polylepis, had a similarity level of 100% identical to the data stored in the ncbi genbank and bold system whose status was already on the red list, namely threatened danger (iucn 2021). this study's results of species identification based on morphological and molecular characters revealed this. the closest genetic distance value was 0.000 from thai waters, according to the findings of a genetic distance comparison of ray sequences from the sesayap river with sequences from other waters obtained from ncbi's genbank. three clades were identified by phylogenetic reconstruction: clade 1, which included the species urogymnus polylepis, clade 2, which included the species urogymmus asperrimus and himantura granulata, and clade 3, which included the species brevitrygon imbricata (out group). keywords urogymnus polylepis, col, iucn, genetic distance, phylogenetics